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• Chapters in a book and Book edition

• Journals

• Papers in International Conferences (with review)

• Papers in national conferences (with review)

• Technical Reports

• Seminars and Invited talks

• Report of students

• Co-authors (partial) list

• Non-professional Publications

Understanding the Dynamics of Biological Systems chapter: Interaction-Based Simulations for Integrative Spatial Systems Biology Application to the Simulations of a Synthetic Multicellular Organism in MGS edited by W. Dubitzky, J. Southgate, H. Fuss 270 p. Springer, ISBN 978-1-4419-7963-6, Feb. 2011	Morphogenesis: Origins of Patterns and Shapes L'origine des formes chapter : Computer Morphogenesis edited by Paul Bourgine and Annick Lesne Springer, ISBN 978-3-642-13173-8 table of content
Systems Self-Assembly: multidisciplinary snapshots chapter: Simulation of self-assembly processes using abstract reduction systems edited by Natalio Krasnogor, Steve Gustafson, David Pelta and Jose L. Verdegay 2008, 304 pages, ISBN-10: 0-444-52865-2 table des matières	Morphogenèse : L'origine des formes chapitre : Morphogenèse Informatique sous la direction de Paul Bourgine et Annick Lesne 2006, 17 x 24 cm, 352 pages, code Belin 004471, ISBN 2-7011-4471-X, EAN 9782701144719 table des matières Interview de Annick Lesne sur France-Culture (10Mb, .rm)
Molecular Computational Models: Unconventional Approaches chapter : Modeling Developmental Processes in MGS edited by Marian Gheorghe (Univ. of Sheffield) 2005, 287 pages, ISBN: 1-59140-334-0 table des matières	Unconventional Programming Paradigms International Workshop UPP 2004, Le Mont Saint Michel, France, September 15-17, 2004, Revised Selected and Invited Papers. Series: Lecture Notes in Computer Science , Vol. 3566 editors: Jean-Pierre Banâtre, Pascal Fradet, jean-Louis Giavitto, Olivier Michel. 2005, XI, 367 p. With online files/update., Softcover. ISBN: 978-3-540-27884-9

• Giavitto Jean-Louis, Beal Jacob, Dulman Stefan, Spicher Antoine, Proceedings of the Int. Workshop on Spatial Computing (SCW 2012) : (co-located with AAMAS 2012). Valencia : IFAMAAS (International Foundation for Autonomous Agents and Multiagent Systems). 2012

• Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher, Olivier Michel, chapter: Interaction-Based Modeling of Morphogenesis in MGS in Morphogenetic Engineering, Doursat, René; Sayama, Hiroki; Michel, Olivier (Eds.), Springer Series: Understanding Complex Systems, in press, 2012.

• J.-L. Giavitto, A. Spicher. Morphogenesis, Origins of Patterns and Shapes, chapter Computer Morphogenesis. 2011, Springer.

• Antoine Spicher, Olivier Michel and Jean-Louis Giavitto. Understanding the Dynamics of Biological Systems: Lessons Learned from Integrative Systems Biology, chapter : Interaction-Based Simulations for Integrative Spatial Systems Biology W. Dubitzky, J Southgate and H. Fuss (editors). Springer-Verlag. To appear.

• Jean-Louis Giavitto, Olivier Michel, and Antoine Spicher. Software-Intensive Systems and New Computing Paradigms, volume 5380 of LNCS, chapter Spatial Organization of the Chemical Paradigm and the Specication of Autonomic Systems, pages 235-254. Springer, november 2008. (chapitre sur invitation et comité de lecture)

• Antoine Spicher and Jean-Louis Giavitto, Systems Self-Assembly: multidisciplinary snapshots chapter: Simulation of self-assembly processes using abstract reduction systems edited by Natalio Krasnogor, Steve Gustafson, David Pelta and Jose L. Verdegay, Elsevier 2008, 304 pages, ISBN-10: 0-444-52865-2

• Olivier Danvy, Andrzej Filinski, Jean-Louis Giavitto, Andy King, Pierre-Etienne Moreau, and Carolyn L. Talcott. Editorial (guest editors for the special issue on rule based programming). Higher-Order and Symbolic Computation, 19(4) :343–344, 2006.

• André De Hon, Jean-Louis Giavitto, and Frédéric Gruau, editors. Computing Media and Languages for Space-Oriented Computation, number 06361 in Dagsthul Seminar Proceedings. Dagsthul, 3-8 september 2006.

• Antoine Spicher and Jean-Louis Giavitto. Morphogenèse : L'origine des formes chapitre : Morphogenèse Informatique. livre sous la direction de Paul Bourgine et Annick Lesne, Belin collection Echelles, 2006, 17 x 24 cm, 352 pages, ISBN 2-7011-4471-X, EAN 9782701144719

• J.-L. Giavitto and O. Michel. Molecular computation models: unconventional approaches, chapter Modeling Developmental Processes in MGS, pages 150-189. Idea Group Publishing, January 2005. ISBN: 1-59140-333-2. bib .pdf

• J.-L. Giavitto, J.-P Banâtre, P. Fradet, and O. Michel, editors. Proceedings of EU-NSF Strategic Research Workshop on Unconventional Programming Paradigms (UPP'04), Mont Saint-Michel, 2004. ERCIM - NFS, ERCIM, http://www.ercim.org/EU-NSF/UPP04-proceedings.pdf. A selection of revised and extended papers have been published in LNCS.

• J.-L. Giavitto, O. Michel, J.-P Banâtre, and P. Fradet. Modèles de programmation non-conventionnels. Technique et Science Informatique, 23:177-186, 2004. Compte-rendu de l'atelier international UPP'04.

• J.-P Banâtre, P. Fradet, J.-L. Giavitto, and O. Michel, editors. Unconventional Programming Paradigms (UPP'04), volume 3566 of LNCS, Le Mont Saint-Michel, France, September 2005. ERCIM - NFS, Springer Verlag. Revised, selected and invited papers. 367 p. ISBN: 3-540-27884-2. http://www.springeronline.com/3-540-27884-2.

• J.-L. Giavitto. Modelling and simulation of biological processes in the context of genomics, chapter On The biochemical abstract machine BIOCHAM, comments on a presentation of François Fages, pages 175-176; chapter On Biologically-inspired Cellular Computing Machines, Comments on a presentation of Christof Teuscher, pages 181-181; chapter On Modelling of Biochemical networks of interactions, Comments on a presentation of Gordon Plotkin, pages 203-204; Genopole & Platypus Press, ISBN 2-84704-0374, 2004.

• F. Képès, P. Amar, G. Barlovatz, G. Bernot, C. Froidevaux, J.-L. Giavitto, J. Guespin, F. Molina, V. Norris, and V. Schächter. Modelling and simulation of biological processes in the context of genomics, chapter "Introduction and Conference synthesis", pages 9-16. Genopole & Platypus Press, ISBN 2-84704-0374, 2004.

• J.-L. Giavitto, C. Godin, O. Michel, and P. Prusinkiewicz. Modelling and simulation of biological processes in the context of genomics, chapter "Computational Models for Integrative and Developmental Biology". Proceedings of the Dieppes spring school 12-16 may 2003. Platipus Press, Nov. 2003, ISBN: 2-84704-036-6.

• J.-L. Giavitto, P.-E. Moreau editeurs. 4th International Workshop on rule-Based Programming (RULE'03), june 2003, Valencia, Spain. Volume 86 issue 2 of ENTCS (electronic note in theoretical computer science). Elsevier, 2003. (online publication date: sept. 2003). Preproceedings are available as the Technical Report DSIC-II/11/03 University of Valencia, Spain. Ce workshop a donné lieu à un numéro spécial de la revue HOSC co-édité par O. Danvy, P.-E. Moreau et moi-même.

• V. Noris, P. Amar, P. Ballet, G. Bernot, F. Delaplace, M. Demarty, J.-L. Giavitto, C. Ripoll, M. Thellier, and A. Zemirline. Modelling and Simulation of biological processes in the context of genomics, chapter ``Hyperstructures. Hermes, July 2002. Also published as a tutorial chapter of the proceedings of the workshop ``Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, 17-21 mars 2002, Autran, France.

• A. Zemirline, P. Ballet, L. Marcé, P. Amar, P. Ballet, G. Bernot, F. Delaplace, J.-L. Giavitto, O. Michel, J.-M. Delosme, R. Incitti, P. Bourgine, C. Godin, F. Képès, P. Tracqui, V. Noris, J. Guespin, M. Demarty, and C. Ripoll. Modelling and Simulation of biological processes in the context of genomics, chapter ``Cellular-automata, Reaction-Diffusion and Multiagents Systems for Artificial Cell Modelling. Hermes, July 2002. Also published as a tutorial chapter of the proceedings of the workshop ``Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, 17-21 mars 2002, Autran, France.

• J.-L. Giavitto, C. Godin, O. Michel, and P. Prusinkiewicz. Modelling and simulation of biological processes in the context of genomics, chapter Computational Models for Integrative and Developmental Biology. Hermes, July 2002. A revised version appears in the proceedings of the Dieppes spring school 12-16 may 2003, published by Platipus Press, ISBN: 2-84704-036-6.

• J.-L. Giavitto and E. Valencia. A Topological Framework for Modeling Diagrammatic Reasoning Tasks. In Diagrammatic Representation and Reasoning. Editors : P. Olivier, M. Anderson and B. Meyer. Springer Verlag. (Livre paru en mars 2002 après avoir été annoncé en 2001.)

• J.-L. Giavitto, editeur. Parallélisme, distribution et objet, volume 9 de Technique et Science Informatique. Hermes Science, 2000. numéro thématique de TSI publié aussi sous la forme d'un livre indépendant.

• Jean-Louis Giavitto, Hanna Klaudel, Franck Pommereau. Integrated Regulatory Networks (IRNs): Spatially organized biochemical modules. TCS, in press. (doi) (preliminary version)

• J.-L. Giavitto, F. Rechenmann. Turing chapitre dans la revue DocSciences numéro 14 Alan Turing : la pensée informatique contribution sous le signe du calcul. DocScience est une revue éditée par le CRDP de l'Académie de Versailles à destination des lycéens et de leurs professeurs.

• José Echeveste, Arshia Cont, Jean-Louis Giavitto, Florent Jacquemard. Formalisation des relations temporelles entre une partition et une performance musicale dans un contexte d’accompagnement automatique : accompagnement musical automatique. Journal Européen des Systèmes Automatisés (JESA). Special issue: proceedings of MSR'2011 (Lille). 2011

• Olivier Michel, Antoine Spicher and Jean-Louis Giavitto. Rule-based programming for integrative biological modeling -- Application to the modeling of the lambda phage genetic switch. Natural Computing, pp 25, 2009.

• Antoine Spicher, Olivier Michel, Mikolaj Cieslak, Jean-Louis Giavitto, and Przemyslaw Prusinkiewicz. Stochastic p systems and the simulation of biochemical processes with dynamic compartments. BioSystems, 91(3):458-472, March 2008. bib .pdf

• Jean-Louis Giavitto and Antoine Spicher. Topological rewriting and the geometrization of programming. Physica D, 237:1302–1314, 2008.

• Alain R. Thierry, François Képès, Patrick Amar, Georgia Barlovatz-Meimon, Gilles Bernot, Marie Beurton-Aimar, Marie Dutreix, Jean-Louis Giavitto, Janine Guespin, Jean-Pierre Mazat, Victor Norris, Vincent Schächter, Philippe Tracqui, Christophe Godin and Franck Molina. Modelling of biological complex systems in the context of genomics.an account of a multidisciplinary thematic seminar held in montpellier (france) in april 2005. Journal of Biological Physics and Chemistry, 6(2) :103–107, 2006.

• O. Michel, J.-P. Banâtre, P. Fradet and J.-L. Giavitto. Challenging Questions for the Rationals of Non-Classical Programming Languages (preliminary version). International Journal of Unconventional Computing (IJUC), Vol. 2, N° 4, 2006, pp. 337-347.

• F. Képès, P. Amar, G. Barlovatz, G. Bernot, C. Froidevaux, J.-L. Giavitto, J. Guespin, F. Molina, V. Norris, and V. Schächter. Modelling and simulating biological processes in the genomic era: an account of a multidisciplinary thematic school held in Évry (france) in april 2004. Journal of Biological Physics and Chemistry, 4:131-136, October 2004.

• J.-L. Giavitto, G. Malcolm and O. Michel. Rewriting Systems and the Modelling of Biological Systems. Comparative and Functional Genomics, 5:95-99, February 2004 (journal version).

• J.-L. Giavitto, O. Michel, and F. Delaplace. Declarative simulation of dynamicals systems : the 8 1/2 programming language and its application to the simulation of genetic networks. BioSystems, 68(2–3):155–170, feb/march 2003.

• J.-L. Giavitto and O. Michel. Modeling the topological organization of cellular processes. BioSystems, 70(2):149–163, 2003.
  Republication in Physics of Life, August(3), 2003. See http://www.physicsoflife.com/index.html. This Elsevier electronic Journal contains selected articles that have been published in 22 contributing journals from Elsevier Science, covering Physics, Biology, Chemistry and Medicine with a focus on biological physics research.

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• P. Amar, P. Ballet, G. Barlovatz-Meimon, A. Benecke, G. Bernot, Y. Bouligand, P. Bourguine, F. Delaplace, J.-M. Delosme, M. Demarty, I. Fishov, J. Fourmentin-Guilbert, J. Fralick, J.-L. Giavitto, B. Gleyse, C. Godin, R. Incitti, F. Képès, C. Lange, L. L. Sceller, C. Loutellier, O. Michel, F. Molina, C. Monnier, R. Natowicz, V. Norris, N. Orange, H. Pollard, D. Raine, C. Ripoll, J. Rouviere-Yaniv, M. Saier, P. Soler, P. Tambourin, M. Thellier, P. Tracqui, D. Ussery, J.-C. Vincent, J.-P. Vannier, P. Wiggins, and A. Zemirline. Hyperstructures, genome analysis and I-cells. Acta Biotheoretica, 50, 2002.

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• Spicher Antoine, Michel Olivier, Giavitto Jean-Louis, Arbitrary Nesting of Spatial Computations. Spatial Computing Workshop SCW12. Valencia : Juin 2012, vol. W21 AAMAS Satellite Workshop P, p. 25-32

• Arshia Cont, José Echeveste, Florent Jacquemard, Jean-Louis Giavitto. Correct automatic accompaniment despite machine listening or human errors in Antescofo. ICMC 2012 (International Computer Music Conference), 9-15 September, Ljubljana, Slovenia.

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• Antoine Spicher, Olivier Michel, and Jean-Louis Giavitto. Algorithmic self-assembly by accretion and by carving in MGS. In Proc. of the 7th International Conference on Artificial Evolution (EA'05), LNCS, University of Lille - France, October 2005. Springer-Verlag.

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• J.-L. Giavitto, O. Michel, and J. Cohen. Accretive rules in cayley p systems. In G. Paun, G. Rozenberg, A. Salomaa, and C. Zandron, editors, Membrane Computing 2002, pages 319–338. LNCS 2597, 2003. Springer.

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• Jean-Louis Giavitto. Rapport scientifique présenté pour l'obtention d'une habilitation à diriger des recherches. Technical Report 1226, Laboratoire de Recherche en Informatique, Septembre 1999.

• J.-L. Giavitto (éditeur). Rapport Scientifique du LaMI. Technical Report 51, LaMI– Université d'Évry Val d'Essonne, Février 2001.

• J.-L. Giavitto and O. Michel. MGS: a programming language for the transformations of topological collections. Technical Report 61-2001, LaMI – Université d'Évry Val d'Essonne, May 2001.

• J.-L. Giavitto and O. Michel. The Topological Structures of Membrane Computing. Technical Report 70-2001, LaMI – Université d'Évry Val d'Essonne, November 2001.

• J.-L. Giavitto, C. Godin, O. Michel and P. Prusinkiewicz. Computational Models for Integrative and Developmental Biology Technical Report 72-2002, LaMI – Université d'Évry Val d'Essonne, Mars 2002. Une version révisé a été publié dans les proceedings du séminaire d'Autran et une version nouvellement révisé comme chapitre de livre chez Hermes.

• J.-L. Giavitto, O. Michel, and J. Cohen. Une présentation du langage MGS. LaMI, université d'Evry, May 2002. (tutoriel).

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• O. Michel and J.-L. Giavitto. Typer une collection par la présentation d'un groupe. In Journées du GDR Programmation, Grenoble, 23-24 Novembre 1995, 1995. GDR Programmation du CNRS.

• O. Michel and J.-L. Giavitto. Amalgams: Names and name capture in a declarative framework. Technical Report 32, LaMI – Université d'Évry Val d'Essonne, January 1998. also avalaible as LRI Research-Report RR-1159.

• P. Pauthe, A. Mauboussin, and J.-L. Giavitto. Advanced user-interfaces: Towards modelisation. Technical report, Laboratoires de Marcoussis, Juillet 1987. (13p.).

• Les Machines Parallèles, Séminaire Sextant Avionique, Septembre 1990.

• Étude et simulation d'algorithmes de routage, Journée du Site Expérimental en Hyperparallélisme (SEH), ETCA, Arcueil, 27-29 Novembre 1990.

• 8-31/2 : un langage dataflow synchrone, séminaire de l'équipe Parallélisme et synchronisation du LRI, Avril 1991.

• Machines parallèles à grille de processeurs tridimensionelle, J.-L. Béchennec, C. Germain, J.-L. Giavitto, F. Cappello, D. Etiemble, J.-P. Sansonnet, Journées Science et Défense, DRET, 1991.

• Un modèle d'exécution MSIMD, séminaire LITP/Paris 7, février 1992.

• Analyse et compilation d'un langage MSIMD, séminaire de l'École des Mines de Paris, Avril 1992.

• Programmation data-parallèle et expression implicite du parallélisme, séminaire de l'Université d'Orléans, novembre 1992.

• Placement et ordonnancement de graphes dataflow data-parallèles, séminaire CHLOE, INRIA-Rocquencourt, 23 mars 1993.

• Placement et Ordonnancement des tâches data-parallèles sur machine à mémoire distribuée, séminaire Architecture du LRI, Avril 1993.

• Un langage data-parallèle déclaratif, séminaire du Site Expérimental en Hyper-parallélisme (SEH) de l'ETCA, 23 juin 1993.

• Le langage 8-31/2 pour la simulation des SDD, séminaire de l'unité de modélisation du CIRAD (Centre International en Recherche Agronomique pour le Développement), Montpellier, février 1994.

• Un modèle déclaratif pour la simulation parallèle synchrone : le langage 8-31/2, séminaire de l'unité de modélisation du LIRM, Montpellier, février 1994.

• Démonstration de la plate-forme 8-31/2 au comité scientifique CNRS du LRI, janvier 1995.

• Placement et ordonancement automatique pour les langages data-parallèles, séminaire Architecture du LRI, février 1995.

• Expression du data-parallélisme dans les langages de programmation, séminaire de l'IDRIS (Centre de calcul du CNRS), Avril 1995.

• Le projet 8-31/2 : résultats et perspectives, séminaire Architecture du LRI, Avril 1997.

• Trois usages de la notion d'espace en informatique : un exemple de calcul data-parallèle, un calcul dataflow dynamique et un problème de représentation des connaissances, séminaire du LIFO (Orléans), Décembre 1997.

• Représentation spatiale pour les calculs régulier, irrégulier et diagrammatique, séminaire du PRiSM, Avril 1998.

• Définition récursive de tableaux et de champs de données. Journées de travail LODEC, Orléans, Décembre 1998.

• Topologie algébrique pour la construction de représentations diagrammatiques. E. Valencia & J.-L. Giavitto. Poster au 7ème colloque de l'association pour la recherche cognitive (ARC), décembre 1998, Université de Paris 8.

• Représentations temporelles et spatiales pour la programmation, soutenance d'Habilitation, LRI, Janvier 1999.

• Outils et représentations topologiques pour la programmation, séminaire du LaMI, Janvier 1999.

• Représentations temporelle et spatiale pour la représentation des connaissances et des comportements, séminaire OASIS du LIP6, Février 1999.

• Définition et ordonnancement de structures de données déclaratives. Conférence invité au workshop Compilation et Parallelisation Automatique, Obernay, Octobre 1999.

• Définition récursives de structures de données déclaratives. Séminaire A3 - INRIA Rocquencourt, Décembre 1999.

• Notions d'espaces discrets dans les langages de programmations. Séminaire du LIRM, Avril 2000.

• Ingénierie des simulations informatiques de processus biologiques. Journées Peri-Bio à l'université d'Évry, Avril 2000.

• Structures régulières d'espace pour la programmation intentionelle des collections. Séminaire de l'IRCOM, Université de Poitier, Février 2001.

• Quelques modèles de calculs pour la modélisation des systèmes dynamiques à structure dynamique. Groupe de travail Simulation : vers l'épigénèse , GENOPOLEet GDR IMPG, Avril 2001.

• Le projet Intelligent Simulation : détection et suivie temporel de structure émergentes. Groupe de travail Simulation : vers l'épigénèse , GENOPOLE et GDR IMPG, décembre 2001.

• Structures régulières d'espace pour la programmation intentionelle des collections. Séminaire de l'équipe PROTEO, CRIN, Nancy, Octobre 2001.

• The Otto e Mezzo project: a dedicated language for the simulation of dynamical systems. Séminaire du département d'informatique de l'université de Calgary. Mars 2002, Calgary, Canada.

• The MGS Project for the simulation of dynamical systems with a dynamic structure. Séminaire du département d'informatique de l'université de Calgary. Mars 2002, Calgary, Canada.

• Animation de la table ronde : Organisation des objets biologiques . Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, 17-21 mars 2002, Autran, France. Mars 2002.

• Topologies des structures de données et langage de règles. (Applications to the modeling of systems with a dynamic structure.) Séminaire du département mathématique, Université de Montpellier. Juin 2002.

• New collections types in MGS. Séminaire du département d'informatique de l'université de Calgary. October 2002, Calgary, Canada.

• Un modèle de programmation non-standard fondés sur des idées topologiques. Séminaire de l'IRISA, Uniiversité de Rennes. Décembre 2002.

• GBF et substitution de chemins: un modèle de programmation pour la simulation des systèmes dynamiques Séminaire de l'université de Metzs. Février 2003.

• Organisation de la journée : Organisation des objets biologiques . Groupe de travail IMPG, 27-28 mars 2003, Evry-Genopole, France.

• Langages à collections et réécriture pour la simulation. Séminaire du LABRI. Bordeaux, avril 2003.

• Modèles de réécriture pour la modélisation en biologie. ACI Cellicium. INPG Grenoble, avril 2003.

• Organisation de la journée : Information de position et localisation spatiale en biologie du développement . Invité : H. Meihnardt, I. Traas, P. Barbier de Reuille, A. Bockmayr, M. Aimar. Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, mai 2003, Dieppes, France.

• Quelques notions nomades entre informatique et biologie. Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, mai 2003, Dieppes, France.

• Typage des collections hétérogènes. Avec J. Cohen et O. Michel. sém. de l'ENS-Ulm (inv. A. Frish et G. Castagna).

• Invited talk: Topological collections, transformations and their application to the modeling and the simulation of dynamical systems. Rewriting Technics and Applications (RTA'03), Valencia (Spain), june 2003.

• Term, bag and string rewriting for the modeling of biological processes. MIPNETS meeting, Liverpool, june 2003. MIPNET meeting, Liverpool, june 2003.

• Systèmes de réécriture et modélisation informatique des systèmes dynamiques à structure dynamique. Première journée Complexité, CNRS, Polytechnique et IHP, novembre 2003. Présentation et participation à la table-ronde avec P. Bourgine, J. Petitot, N. Peyrieras, P. Pumain et A. Lecques.

• Matching a path in a data-structure – The derivative of a pattern. Séminaire du département d'informatique de l'université de Calgary. December 2003, Calgary, Canada.

• Organisation de la journée : Modéles formels pour la modélisation biologique . Invité : G. Plotkin, V. Danos, F. Fages, C. Teuscher et H. Meihnardt. Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, mars 2004, Evry, France.

• The MGS project. Séminaire de l'équipe AGATA. CEA - Saclay, mars 2004.

• Mouvement et calcul dans une structure de donnée : une approche langage fondé sur des notions topologiques. Séminaire du projet Alchemy. LRI-INRIA, mars 2004.

• Unconventional Programming Paradigms: Preliminary Notes for a Debate. EU-NSF Workshop, Mont Saint-Michel, 2004.

• Calcul dans l'espace et espace du calcul. Séminaire d'algorithmique de Caen. Janvier 2005.

• Computation in Space and Space in Computation. Computer Science Department / University of Liverpool. Février 2005.

• Organisation et animation de la journée : Chimie artificielle et cellule virtuelle. Invité : B. Pau, F. Houllier, P. Dittrich, M. Amos, A. Griffiths. Modélisation et simulation de processus biologiques dans le contexte de la génomique, avril 2005, Montpellier.

• Systèmes de réécriture et modélisation informatique des systèmes dynamiques à structure dynamiques. Ecole de printemps de Berder : ``Information et Optimisation : quel dialogue entre la biologie et les autres disciplines ?''. Ile de Berder, avril 2005.

• The chemical paradigm, programming in space and the implementation of autonomic systems. In Unconventional computation : Quo Vadis, Santa-Fe, 21-23 march 2007. Center for Nonlinear Studies (CNLS). (invited speaker).

• Interlink workshop. working group on ”software intensive systems and new computing paradigms”. Spatial Computing., 10-12 may 2007, Eze.

• Interlink workshop. working group on ”software intensive systems and new computing paradigms”. Spatial programming and autonomic computing., 3-4 december 2007, Munich.

• Programming language, distributed computing and the reconstruction of biological systems in ”what are the theoretical tools most useful for understanding biological systems ?” colloque de l'IHES, 12-15 november 2007.

• Interlink workshop. working group on ”software intensive systems and new computing paradigms”. Chemical Paradigm and distributed computing, 28-29 July 2008, Urbana-Champaign, Illinois, USA.

• Interlink workshop. working group on ”software intensive systems and new computing paradigms”. Consolidation Workshop. 12-14 November 2008, Cannes.

• Ca se calcule, c’est un calcul, parce que ca calcule. in ”la thèse de Church : hier, aujourd’hui, demain – regards croisés de philosophes et de théoriciens du calcul”, colloque d’histoire et philosophie de l’informatique, 11 april 2008.

• Modelling and simulation of dynamical systems with a dynamical structure. In FoodSim’08, Dublin, 26-26 june 2008. Eurosis.

• Jean-Louis Giavitto and Olivier Michel. Topological structure of interactions. 1st European Workshop on Correlations in Computer Science, 6-7 august 2008.

• Jean-Louis Giavitto and Olivier Michel. Topologie combinatoire et programmation. Rencontre toulousaine graphes et topologie, 30 june 2008.

• Pourquoi la communication scientique en françcais. Table ronde "quel avenir pour les conferences francophones" In Rencontre nationales du GDR GPL, Toulouse, 27 janvier 2009.

• Le calcul, une notion difficile à attraper. Sur le site de Interstice.

• La bactérie, le simulateur et son modèle. In LIGC'09 : Egalité, identité, isomorphisme, Florence, septembre 2009. (invited speaker, unpublished).

• Conceptions de machines fluides. In SISC'09 : Vers une science et ingénierie des systèmes complexes, Colloque RNSC - CNRS, Novembre 2009. (invited speaker, vidéo en ligne).

• Jean-Louis Giavitto avec A. Spicher et O. Michel. Trois usages de notions spatiales en programmation et en représentation des connaissances In Séminaire MaMux, IRCAM, Novembre 2009.

• Design Patterns of Pattern Formation and Morphogenesis in a Declarative Programming Language. In Conférence Interdisciplinaire sur la Formation des Motifs dans la Morphogénèse, IHES, janvier 2010. (invited speaker, unpublished).

• Un langage dédié à la simulation de processus de morphogenése. In Groupe de travail Bio, LIENS, Ecole Normale, février 2010.

• Modèles de calculs bio-inspirés et modèles de calcul pour la biologie. In Quelles interactions entre biologie synthétique et micro-nanotechnologies ? Journées OMNT - CEA (Observatoire des micro- et nano-technologies), Grenoble, mars 2010. (invited speaker, published through a CD-ROM distributed by OMNT-CEA)

• A Domain Specic Language for Complex Natural & Articial Systems Simulations. In Int. workshop on Language Descriptions Tools and Applications (LDTA'10), Paphos. (invited speaker, abstract on proc. published at ACM digital library).

• Outils et langages de simulation de processus biologiques. In Groupe de travail Nanotechnologie pour la biologie, CEA Saclay, mars 2010.

• Declarative simulation of dynamical structure. In Int. Coll. Morphogenesis in Living Systems, Paris, May 2010. (invited speaker, unpublished).

• Des calculateurs universels sur le site d'Interstice.

• MGS, a declarative spatial computing programming language, In New World Of Computation 2011, Orleans, May 2011. Slides.

• MGS : un langage déclaratif pour la programmation spatiale. Séminaire SupMeca, mai 2011. Slides.

• Programmation spatiale : applications à la biologie du développement, à l'analyse des contes de fées et à l'analyse musicale. Séminaire du LIRIS, mars 2011. Slides

• Andreatta Moreno, Giavitto Jean-Louis and Bigo Louis, Spicher Antoine, Agon Carlos. Outils algébriques et représentations géométriques en musicologie computationnelle : le paradigme de la programmation spatiale et ses applications en informatique musicale. Journéees LAC – GeoCal, Polytechnique, novembre 2011. Slides

• Calculer différemment sur le site d'Interstice.

• Interview Antescofo sur la radio en ligne Quadrivium, une émission consacrée au projet Antescofo (diffusé le 7 janvier 2012, entretien avec Arshia Cont, J.-L. Giavitto et J. Echeveste)

• Programmation spatiale : application à l'analyse des contes de fées et à l'analyse musicale, séminaire IPAC, Nancy mars 2012.

• Arbitrary Nesting in Spatial Computation, Spatial Computing Workshop 2012 at AAMAS, 5 june, Valencia, Spain.

• Du temps écrits au temps produit avec Arshia Cont. Intervention au colloque Produire le temps, 14 & 15 juin, Ircam - ENS - Polytechnique, Paris.
  A computation must end: from its very beginnings with Turing, computer science has taken the notion of time into account. Time is a resource, organized by computer scientists in computer languages using notions of successions, simultaneity, and duration. Nevertheless, such views of time have limitations. First, because these three notions do not exhaust the forms of computer time—logical or real, event-based or continuous, linear or branching—nor do their applications, as can be seen in the example of the production of time in real-time computer music. Second, while time is a resource for computer systems, these systems must also interact with humans and our lived time. The computation of time consequently becomes an open process that must be captured live. The computer scientist is therefore confronted with other dimensions of time such as movement, memory and learning, expectation and anticipation.

• Susan Stepney, Ada Diaconescu, Rene Doursat, Jean-Louis Giavitto, Taras Kowaliw, Ottoline Leyser, Bruce MacLennan, Olivier Michel, Julian F. Miller, Igor Nikolic, Antoine Spicher, Christof Teuscher, Gunnar Tufte, Francisco J. Vico and Lidia Yamamoto. Gardening Cyber-Physical Systems. Unconventionnal Computation and Natural Computation (UCNC'2012), Lecture Notes in Computer Science, 2012, Volume 7445/2012. Poster.

• Jean-Louis Giavitto. À propos des nouveaux langages de programmation. Podcast audio sur le site web Interstice, Interstice, Juillet 2012.

• Jean-Louis Giavitto, Antoine Spicher. MGS Tutorial. Special Session at Unconventional Computation and Natural Computation (UCNC’2012), 3-7 Septembre 2012. (about 400 slides). Cf. http://www.spatial-computing.org/mgs:tutorial

• Jean-Louis Giavitto, François Reichenman. Sous le signe du calcul. Interstice.

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• O. Michel. Représentations dynamiques de l'espace dans un langage déclaratif de simulation. thèse de l'Université de Paris-Sud, centre d'Orsay, December 1996. N°4596.

• P.-A. Nguyen. Représentation et construction d'un temps asynchrone pour le langage 81/2, Avril-Juin 1994. Rapport d'option de l'École Polytechnique.

• P. Robert. Une interface graphique extensible. Rapport du stage du DESS Information et Communication Homme-Machine de l'université de Valenciennes et du Hainaut Cambrésis, Juin 1989.

• J.-V. Segard. Modèles de morphogénèse biologique dans sun langage déclaratif de simulation, Septembre 1997. Rapport de stage du DEA de Sciences Cognitives, Université de Paris-Sud.

• J. Soula. Champs de données basés sur les groupes en 81/2, Juin 1996. Rapport de stage du DEA Architectures Parallèles de l'Université de Paris-Sud.

• E. Valencia. Un modèle topologique pour le raisonnement diagrammatique, August 1997. Rapport pour le DEA Sciences Cognitives, LIMSI. Voir aussi http://www.lami.univ-evry.fr/~giavitto/UTopoia.

• E. Valencia. Outils de topologie algébrique pour la gestion de l'hétérogénéité sémantique entre agents dialogiques. Thèse de doctorat, LIMSI, Université de Paris-Sud, Decembre 2000.

• F. Letierce. Représentation de scènes 3D avec contraintes symboliques de position. mgs. Master's thesis, Maîtrise de l'université d'Evry Val d'Essone, juin 2001.

• C. Bouin and N. Thibault. Hyperstructure et modélisation de chimie artificielle dans le langage mgs. Master's thesis, Maîtrise de l'université d'Evry Val d'Essone, juin 2002.

• E. Delsinne. Structure de données indexées par un groupe : isomorphisme de GBF abéliens et extensions aux structures automatiques. Stage de magistère de l'école normale. Septembre 2002.

• V. Larue. Structure de données indexées par un groupe : représentation graphique et extensions à des cas non-abéliens. Stage de DEA informatique. Septembre 2002.

• A. Spicher. Typage et compilation de filtrage de chemins dans des collections topologiques. Stage de DEA bio-informatique. Stage de 3ème année d'école d'ingénieur. Septembre 2003.

• B. Calvez. Un frontal graphique et génération automatique de la documentation pour le langage de programmation MGS. Stage de 2ème année d'ingénieur à l'IIE (Evry). Septembre 2003.

• F. Thonnerieux. Description et visualisation de scène 3D pour le langage de programmation MGS. Stage de 2ème année d'ingénieur à l'IIE (Evry). Septembre 2003.

• J.-P. Lambert. Combinateur de Diller et évaluation au vol de trait impératif. Stage de TER maîtrise. Juin 2003.

• Amar P
• Béchennec J.-L.
• Banâtre J.-P.
• Barlovatz G
• Benoit C
• Bernardini F
• Bernas P
• Bernot G
• Cappello F
• Cohen J
• Cont A
• De Vito D
• Delaplace F
• Devarenne A
• Echeveste J
• Etiemble D
• Fowler J
• Fradet P
• Froidevaux C
• Germain C
• Gheorghe M
• Godin C
• Guespin J
• Holvoet Y
• Jacquemard F
• Képès F
• Klaudel H.
• Krasnogor N
• Mahiout A
• Malcolm G
• Mauboussin A
• Michel O
• Molina F
• Moreau P.-E.
• Neri V
• Norris V
• Pauthe P
• Pommereau F.
• Prusinkiewicz P
• Rosuel G
• Sansonnet J.-P.
• Schächter V
• Spicher A
• Valencia E

I am member of the SACD (société des auteurs et compositeurs dramatiques):

• Gay refuge script jointly written with D. Blasco for CanalPlus (2'20), décembre 2002.

• Le Philosophe et le gogo-dancer script jointly written wit D. Blasco, for CanalPlus (2'20), décembre 2002.

• Le chercheur et son dessous-de-plat articulé, script and play for a short movie by Cyrille Doucan, (5'07), mai 2003.

• Au folle les pompiers, script jointly written with D. Blasco, for CanalPlus (3'05), septembre 2003.

• Lueur secrète, script written with D. Blasco, end 2008 - begin 2009.

• Toilettes Publiques aka Toilettes Zones, by D. Blasco from the novel "Gents" by Warwick Collins (Orion Books) (translated in french : "La Pissotière" 10/18). (Arte, région Nord-Picardie and CNC). Best Short Film – Audience Award at Queer Lisboa Film Festival. Can be viewed and buyed on Arte video on demand.

• Avenue de France, script written with D. Blasco, begin 2009. Grant from the "Ville de Paris" 2009. Produced (2010) by Filmo Productions. COSIP CNC. Pré-achat et diffusion TPS and TV5. Prix : Festival de Mougon (Prix de la commune), 10èmes Rencontres du Cinéma Européen de Vannes (Prix Cin’écran - Jury Jeunes). Sélection en festivals : Soirée Courts à l’Escurial de Paris, Fuji Tous courts, Festival du Film Policier de Liège, 10èmes Rencontres du Cinéma Européen de Vannes, Festival du court métrage de Mougon, Péniche Cinéma, Côté Court de Pantin, Programme Fairecourt de Picardie, Festival du court métrage de Mâcon, Sélection Prix uniFrance du court métrage Cannes 2011, 37ème Badalona Film Festival (Barcelone), Cristal Festival (Suisse), Ourense Film Festival (Espagne), Festival de Contis, Festival Cinéma et droits humains (Amnesty International), Festival du Film Hyères les Palmiers, Festival international du cinéma francophone en Acadie (Québéc), Festival du film de Rio, Fuji court (paris). Journée Court-Bouillon, Paris La Péniche Cinéma, décembre 2011. Sélection hors-compétition au festival des 24 courts, Le Mans, France, février 2012.

• Mosaic Palace Hotel, script written with D. Blasco. Selected by the "Guide des scénaristes" for the "Atelier franco-égyptiens" in 2011.

Consulting on the scripts:

• Acquasanta by D. Blasco and P. Barassat (from the eponyme A. Gide's short-story; this project wins a grant from the CNC and another one from the Fondation Beaumarchais).

• Petit Frère by D. Blasco from the dialogues of Femmes, Femmes by P. Vechialli and N. Simsolo.

• Abattoir short movie (26mn., Canal+, CNC, région Basse Normandie) by Didier Blasco from an original script by D. Blasco.